MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 49585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3021	NC_020834	GT	3	6	154913	154918	0 %	50 %	50 %	0 %	472335398
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3092	NC_020834	ATTT	2	8	158982	158989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_020834	GCA	2	6	159117	159122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335403
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3101	NC_020834	TGCT	2	8	159640	159647	0 %	50 %	25 %	25 %	472335403
3102	NC_020834	AATGC	2	10	159676	159685	40 %	20 %	20 %	20 %	472335403
3103	NC_020834	A	7	7	159718	159724	100 %	0 %	0 %	0 %	472335403
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3107	NC_020834	A	7	7	159970	159976	100 %	0 %	0 %	0 %	472335403
3108	NC_020834	TTG	2	6	159995	160000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335403
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3111	NC_020834	AGCA	2	8	160261	160268	50 %	0 %	25 %	25 %	472335404
3112	NC_020834	A	6	6	160288	160293	100 %	0 %	0 %	0 %	472335404
3113	NC_020834	A	6	6	160315	160320	100 %	0 %	0 %	0 %	472335404
3114	NC_020834	ATG	2	6	160327	160332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335404
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3116	NC_020834	ATC	3	9	160396	160404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472335404
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3122	NC_020834	GGCAG	2	10	160582	160591	20 %	0 %	60 %	20 %	472335405
3123	NC_020834	TGA	2	6	160606	160611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335405
3124	NC_020834	AAGA	2	8	160646	160653	75 %	0 %	25 %	0 %	472335405
3125	NC_020834	GAA	2	6	160703	160708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335405
3126	NC_020834	GAATCA	2	12	160735	160746	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	472335405
3127	NC_020834	ATT	2	6	160760	160765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335405
3128	NC_020834	TTA	2	6	160772	160777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335405
3129	NC_020834	GATT	2	8	160798	160805	25 %	50 %	25 %	0 %	472335405
3130	NC_020834	TTG	2	6	160922	160927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335405
3131	NC_020834	TGG	2	6	160992	160997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335405
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3133	NC_020834	TGA	2	6	161287	161292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335405
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3136	NC_020834	ACC	2	6	161501	161506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335405
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3138	NC_020834	TG	3	6	161537	161542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_020834	T	6	6	161553	161558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3140	NC_020834	A	7	7	161572	161578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_020834	AGC	2	6	161588	161593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_020834	T	7	7	161596	161602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3143	NC_020834	A	7	7	161611	161617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3144	NC_020834	CAC	2	6	161651	161656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3145	NC_020834	ACG	2	6	161660	161665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3147	NC_020834	TCC	2	6	161749	161754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3148	NC_020834	AGG	2	6	161814	161819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_020834	TGA	2	6	161838	161843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3151	NC_020834	ACT	2	6	161881	161886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3152	NC_020834	TAT	2	6	161908	161913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_020834	ACT	2	6	161970	161975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3154	NC_020834	TAT	2	6	161997	162002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_020834	A	6	6	162050	162055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_020834	CAC	2	6	162067	162072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3157	NC_020834	ACG	2	6	162076	162081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3158	NC_020834	GGT	2	6	162132	162137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_020834	TCC	2	6	162165	162170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3160	NC_020834	AGG	2	6	162230	162235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_020834	TGA	2	6	162254	162259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_020834	ATC	2	6	162263	162268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3164	NC_020834	T	6	6	162290	162295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_020834	AAT	2	6	162301	162306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3166	NC_020834	TCACT	2	10	162360	162369	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3167	NC_020834	TAT	2	6	162388	162393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3168	NC_020834	AAT	2	6	162412	162417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3169	NC_020834	T	7	7	162468	162474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3170	NC_020834	T	8	8	162496	162503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3173	NC_020834	CT	3	6	162588	162593	0 %	50 %	0 %	50 %	472335406
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3210	NC_020834	ATA	2	6	164058	164063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3212	NC_020834	AAG	2	6	164100	164105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3213	NC_020834	AAT	2	6	164162	164167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472335407
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3226	NC_020834	ATT	3	9	164815	164823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335407
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3229	NC_020834	T	6	6	164865	164870	0 %	100 %	0 %	0 %	472335407
3230	NC_020834	TCA	2	6	164964	164969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3231	NC_020834	ATTT	2	8	165018	165025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_020834	AGC	2	6	165092	165097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335408
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3236	NC_020834	CCAA	2	8	165253	165260	50 %	0 %	0 %	50 %	472335408
3237	NC_020834	GGT	2	6	165317	165322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335408
3238	NC_020834	CCA	2	6	165334	165339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472335408
3239	NC_020834	A	6	6	165356	165361	100 %	0 %	0 %	0 %	472335408
3240	NC_020834	GCA	2	6	165423	165428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335408
3241	NC_020834	AGC	2	6	165431	165436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472335408
3242	NC_020834	GAA	2	6	165537	165542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335408
3243	NC_020834	GGC	2	6	165626	165631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472335408
3244	NC_020834	GGCA	2	8	165680	165687	25 %	0 %	50 %	25 %	472335408
3245	NC_020834	GTT	2	6	165720	165725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472335408
3246	NC_020834	CT	3	6	165744	165749	0 %	50 %	0 %	50 %	472335408
3247	NC_020834	TGG	2	6	165751	165756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335408
3248	NC_020834	GAT	2	6	165882	165887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335408
3249	NC_020834	A	6	6	165927	165932	100 %	0 %	0 %	0 %	472335408
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3251	NC_020834	AATG	2	8	166029	166036	50 %	25 %	25 %	0 %	472335409
3252	NC_020834	GAA	2	6	166111	166116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472335409
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3349	NC_020834	AT	3	6	172116	172121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3350	NC_020834	ATT	3	9	172180	172188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3351	NC_020834	TCAT	2	8	172203	172210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3352	NC_020834	AC	3	6	172280	172285	50 %	0 %	0 %	50 %	472335415
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3360	NC_020834	GATT	2	8	172641	172648	25 %	50 %	25 %	0 %	472335415
3361	NC_020834	TAAGGC	2	12	172729	172740	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472335415
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3363	NC_020834	CCAAA	2	10	172907	172916	60 %	0 %	0 %	40 %	472335415
3364	NC_020834	GAT	2	6	172919	172924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472335415
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3367	NC_020834	G	6	6	173224	173229	0 %	0 %	100 %	0 %	472335415
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3369	NC_020834	CTTT	2	8	173306	173313	0 %	75 %	0 %	25 %	472335415
3370	NC_020834	T	6	6	173311	173316	0 %	100 %	0 %	0 %	472335415
3371	NC_020834	ACA	2	6	173356	173361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335415
3372	NC_020834	ATT	2	6	173422	173427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472335415
3373	NC_020834	CAA	2	6	173429	173434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472335415
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3375	NC_020834	TCAA	2	8	173542	173549	50 %	25 %	0 %	25 %	472335415
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3499	NC_020834	GTGGCG	2	12	180043	180054	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	472335422
3500	NC_020834	TGG	2	6	180107	180112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472335422

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